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國立臺灣大學農藝學系
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吳泓熹
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吳泓熹
吳泓熹
基本訊息
職稱
助理教授
組別
生物統計組
實驗室/辦公室
農藝館205室
聯絡電話
(02)3366-4758
E-mail
stevenwu@ntu.edu.tw
Achievement
STEVEN HUNG-HSI WU
網頁
https://stevenhwu.github.io
研究領域
教授課程
簡歷
研究室成員
學術著作
榮譽
研究領域
Computational biology 計算生物
Bioinformatics 生物資訊
Microbial community ecology 微生物群系
Molecular evolution and population genetics 演化生物/群體遺傳
Software development 軟體開發
教授課程
Agron5050 - Introduction to Bioinformatics 生物資訊學導論
Agron5106 - Computational Skills for Biological Data Analysis 生物數據分析的計算技能
Agron2002 - Statistics 統計學
Agron7002 - Seminar 專題討論
簡歷
學歷
學校名稱
國別
系所
學位
起迄年月
奧克蘭大學 University of Auckland
紐西蘭
生物
博士
2014年
奧克蘭大學 University of Auckland
紐西蘭
生物資訊
學士
2006年
經歷
服務機關
職稱
部門/系所
擔任職務
起迄年月
BioConsortia, Inc. 美國生物聯盟公司
Senior consultant 資深顧問
2020年08月 ~ 2021年07月
BioConsortia, Inc. 美國生物聯盟公司
Head of Bioinformatics 資深科學家 - 生物資訊
2017年02月 ~ 2020年08月
Arizona State University 美國亞利桑那州州立大學
Postdoctoral researcher 博士後研究員
2014年08月 ~ 2017年02月
Duke University 美國杜克大學
研究員
2010年12月 ~ 2014年07月
重要職務
服務機關
國別
系所
學位
起迄年月
月
研究室成員
Master's Students
吳昱漢 Yu-Han Wu
澹思亭 Szu-Ting Tan
Undergraduate Students
陳善恩 Shawn Chen
Lab Alumni
Master's Students
張廷融 Ting-Jung Zhang
賴以勳 Yi-Syun Lai
林以正 Yi-Cheng Lin (Co-supervised)
Undergraduate Students
林宥萱 Sandy Lin
葉政翔 Zheng-Xiang Ye
袁帥 Max Yuan
李鴻根 Kent Daniel
學術著作
A.期刊論文
Year
Article
2019
Timing the Evolutionary Advent of Cyanobacteria and the Later Great Oxidation Event Using Gene Phylogenies of a Sunscreen
mBio. 10 (3) e00561-19
2019
Fungal endophytes of Populus trichocarpa alter host phenotype, gene expression and rhizobiome composition
Molecular Plant-Microbe Interactions®. 32 (7) 853-864
2018
Mercury Contamination in Riverine Sediments and Fish Associated with Artisanal and Small-Scale Gold Mining in Madre de Dios, Peru
International Journal of Environmental Research and Public Health. 15 (8) 1584.
2018
accuMUlate: a mutation caller designed for mutation accumulation experiments
Bioinformatics. 34 (15) 2659-2660
2017
Models of microbiome evolution incorporating host and microbial selection
Microbiome. 5 (1) 127
2017
Estimating error models for whole genome sequencing using mixtures of Dirichlet-multinomial distributions
Bioinformatics. 33 (15) 2322-2329
2017
Comparative genomics of Mortierella elongata and its bacterial endosymbiont Mycoavidus cysteinexigens
Environmental Microbiology. 19 (8) 2964-2983
2016
Low Base-Substitution Mutation Rate in the Germline Genome of the CiliateTetrahymena thermophil
Genome Biology and Evolution. 8 (12) 3629-3639
2015
Neutral Models of Microbiome Evolution
PLOS Computational Biology. 11 (7) e1004365
2015
Estimation of evolutionary parameters using short, random and partial sequences from mixed samples of anonymous individuals
BMC Bioinformatics. 16 (1) 357
2013
Transient Compartmentalization of Simian Immunodeficiency Virus Variants in the Breast Milk of African Green Monkeys
Journal of Virology. 87 (20) 11292-11299
2013
Coalescent Entanglement and the Conditional Dependence of the Times to Common Ancestry of Mutually Exclusive Pairs of Individuals
Journal of Heredity. 104 (1) 86-91
2012
Plasma Clusterin Increased Prior to Small for Gestational Age (SGA) Associated With Preeclampsia and Decreased Prior to SGA in Normotensive Pregnancies
Reproductive Sciences. 19 (6) 650-657
2012
Molecular phylogeny of the Entomophthoromycota
Molecular Phylogenetics and Evolution. 65 (2) 682 - 694
2012
A Bayesian model for classifying all differentially expressed proteins simultaneously in 2D PAGE gels
BMC Bioinformatics. 13 (1) 137
2011
Prediction of Preeclampsia and Delivery of Small for Gestational Age Babies Based on a Combination of Clinical Risk Factors in High-Risk Women
Hypertension in Pregnancy. 30 (1) 58-73
2009
An altered pattern of circulating apolipoprotein E3 isoforms is implicated in preeclampsia
Journal of Lipid Research. 50 (1) 71 - 80
2009
A Statistical Model to Identify Differentially Expressed Proteins in 2D PAGE Gels
PLoS Computational Biology. 5 (9) e1000509
2009
A proteomic approach identifies early pregnancy biomarkers for preeclampsia: Novel linkages between a predisposition to preeclampsia and cardiovascular disease
Proteomics. 9 (11) 2929-2945
B.專書之論文
B. 專書之論文
榮譽
得獎年度
頒獎名稱
頒獎單位
2017
臺灣農藝學會106年個人學術獎
台灣農藝學會